Claude engineered proteins that bind scorpion toxins

📌Claude спроектировал белки, которые связывают токсины скорпиона Научная команда Anthropic отчиталась об эксперименте, в котором внутренняя исследовательская модель Claude почти без участия людей провела кампанию по белковому дизайну. Мишенями стали пять нейротоксинов скорпионов, а придумать модель должна была минибиндеры, небольшие белки, которые прочно цепляются к заданной мишени. Укусы скорпионов ежегодно дают больше миллиона пострадавших и тысячи смертей. Нынешние противоядия получают из сыворотки живого биоматериала, они дороги и долго производятся. Белок, спроектированный с нуля, в перспективе мог бы лечь в основу более дешёвого препарата. Люди написали начальный запрос и четыре уточнения, а дальше модель вела работу сама. Она нашла структуры токсинов в открытых базах, выбрала участки для связывания, задала себе пороги качества, скомбинировала двенадцать инструментов дизайна и написала отчёт по результатам. Из примерно 318 тысяч вариантов она отобрала на синтез 180, люди добавили ещё 31. Вся кампания заняла около 64 часов и примерно 10 тысяч часов работы ускорителей совокупно. Две независимые лаборатории проверили все 211 белков, и критериям связывания удовлетворили 17, каждый против одного токсина. Среди кандидатов на один токсин сработали 11 из 60, и такую долю авторы называют обычной для белкового дизайна. Два лучших белка связывают токсин Cn2 с силой в единицы наномолей, слабее известных антител против него. А вот кандидаты, которых проектировали сразу против всех пяти токсинов, провалились целиком, ни один из 91 не связал больше одного. Нейтрализацию токсина не проверяли ни на клетках, ни на животных, так что противоядием Anthropic свою работу не называет. Все 211 конструкций и данные по ним компания выложила в открытый доступ. @ai_machinelearning_big_data